محتوى المقال

Adelaja Akinlolu Nabila Sule Maryam Muhammed David Oyedepo Maryam Olawole Mercy Adejumo Yusuf Anigilaje Moshood Yusuf Precious Omole Temiloluwa Bukoye Tomilayo Olatunji Samuel Shodiya Rahman Bolarinwa

الملخص

تعتبر نيجيريا أكثر الدول الإفريقية كثافة سكانية، إذ تحتوي على ما يزيد على 250 مجموعة عرقية. وتأتي قبيلة الفولاني في الترتيب الثاني، وقبيلة اليوروبا في الترتيب الرابع كأكبر مجموعات عرقية في البلاد. ويستخدم التنميط الجيني الجنائي لتكرار الترادف القصير (STRs) في حساب الـ DNA المشترك لقواعد البيانات الخاصة بنظام الفهرسة للأفراد والمجموعات العرقية. وقد قمنا بفحص تنوع الأليلات، وتواتر النمط الفردي، وكذلك تنوع النمط الفردي،  وبيانات التنميط الجيني الجنائي للتكرار الجسمي للترادف القصير لسكان قبيلتي الفولاني واليوروبا في مدينة هورين بولاية كوارا، في شمال وسط نيجيريا، وذلك لتقديم المزيد من بيانات التنميط الجيني الجنائي لهاتين المجموعتين العرقيتين.

فقد تم أخذ عينات من خمسة وعشرين ذكرًا من قبيلة الفولاني وعينات لثلاث وعشرين أنثى من قبيلة اليوروبا تم تأكيد انتمائهم العرقي لثلاثة أجيال (من ناحية الأب ومن ناحية الأم). وأخذت هذه العينات بموافقتهم على استخدامها لأغراض معينة. وقد كان جميع أصحاب العينات غير مرتبطين بقرابة النسب.

تم تكثير العينات باستخدام أدوات التضخيم من نوع   Surel«R» 21 G PCR الذي يحتوي على الأميلوجينين ، وكذلك أماكن التموضع الـ 20 لتكرار الترادف القصير، وبعد ذلك تم تنميطها بالطريقة الكهربائية الشعرية.

وأكدت التحاليل الإحصائية لمعايير التنميط الجيني الجنائي عدم وجود اختلاف عن المتوقع لتوازن هاردي-وينبيرغ، وعدم الاعتماد للأليلات بين المواقع.

كانت جميع المواقع التي تم اختبارها متعددة الأشكال.  وقد أظهرت معايير تغاير الزيكوتات المتوقعة والتنوع الجيني تنوعًا جينيًا أقل بين أفراد قبيلة الفولاني بالمقارنة مع أفراد قبيلة اليوروبا.  وقد يعود السبب في ذلك للزواج الشائع بين أبناء وبنات الأعمام والعمات في قبيلة الفولاني، والذي تحرمه العادات في قبيلة اليوروبا.

التنزيلات

تنزيل البيانات ليس متاحًا بعد.

المراجع

Alaba OO, Olubusoye OE, Olaomi JO. Spatial patterns and determinants of fertility levels among women of childbearing age in Nigeria. S Afr Fam Pract. 2017 Aug 29;59(4):143-7. https://doi.org/10.1080/20786190.2017.1292693

National Population Commission, Nigeria. 2006 Population and housing census of Nigeria. Nat Population Comm [Internet]. 2015 [cited Feb 19]. Available from: http://www.population.gov.ng/index.php/censuses.

Mustapha AR. Ethnic structure, inequality and governance of the public sector in Nigeria. Geneva, Switzerland: United Nations Research Institute for Social Development; 2006 Nov.

Okolie VO, Cisana S, Schanfield MS, Akanmu AS, Adekoya KO, Oyedeji OA, Podini D. Correction to: Population data of 21 autosomal STR loci in the Hausa, Igbo and Yoruba people of Nigeria. Int J Legal Med. 2018 May 1;132(3):739-. https://doi.org/10.1007/s00414-018-1779-7

Vicente M, Priehodová E, Diallo I, Podgorná E, Poloni ES, Černý V, Schlebusch CM. Population history and genetic adaptation of the Fulani nomads: Inferences from genome-wide data and the lactase persistence trait. BMC genom. 2019 Dec;20(1):1-2. https://doi.org/10.1186/s12864-019-6296-7

Budowle B, Shea B, Niezgoda S, Chakraborty R. CODIS STR loci data from 41 sample populations. J Forensic Sci. 2001;46(3):453-89. https://doi.org/10.1520/JFS14996J

Fan H, Chu JY. A brief review of short tandem repeat mutation. Genom, Proteom Bioinform. 2007;5:1-3. https://doi.org/10.1016/S1672-0229(07)60009-6

Greenbaum G, Templeton AR, Zarmi Y, Bar-David S. Allelic richness following population founding events – A stochastic modeling framework incorporating gene flow and genetic drift. PLoS ONE. 2014;9(12):e115203. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0115203

Ito H, Chiku S, Inoue E, Tomita M, Morisaki T, Morisaki H, Kamatani N. Estimation of haplotype frequencies, linkage-disequilibrium measures, and combination of haplotype copies in each pool by use of pooled DNA data. Am J Hum Genet. 2003;72:384-98. https://doi.org/10.1086/346116

Butler MJ. Genetics and genomics of core short tandem repeat loci used in human identity testing. J Forensic Sci. 2006;51:2. https://doi.org/10.1111/j.1556-4029.2006.00046.x

Wyner N, Barash M, McNevin D. Forensic autosomal short tandem repeats and their potential association with phenotype. Front Genet. 2020;11:884. https://doi.org/10.3389/fgene.2020.00884

Akinlolu AA. Facial biometrics using Akinlolu-Raji image-processing algorithm and anthropological facts which prove that Kebbi and Zamfara Hausas are Hausa Bakwai. Sub-Saharan African J Med. 2016;3:45-52. https://doi.org/10.4103/2384-5147.176320

Valdés ABG, Rocha JEB, Castro JMM, Perez-Plasencia C. Microbiota and breast cancer in Mexican women. Conference Abstract PS16-35. San Antonio Breast Cancer Virtual Symposium; San Antonio, Texas. 2020; December 8-11.

Barbaro A, Falcone G. Internal Validation of a 21 Autosomal STR Multiplex using half reaction volumes: the SureID® 21G Human STR Identification kit; Forensics 2020, Tokyo, Japan. 2020; June 22-23.

Joseph O, Muhammed Y, Raji A, Joseph A. Utilization of herbal medicine among inhabitants of urban Centre in North-Central Nigeria. Algerian J Nat Prod. 2016;4:367.

Crow JF. Hardy-Weinberg and language impediments. Genet. 1999;152:821-25. https://doi.org/10.1093/genetics/152.3.821

Mohammed JA, Hameed IA, Kareem MA. Detection of new variant “off ladder” at the D12S391, D19S433 and D1S1656 loci and tri-allelic pattern at the D16S539 locus in a 21 locus autosomal Short Tandem Repeat database of 400 Iraqi individuals. Academic J. 2015;14(5):375-99. https://doi.org/10.5897/AJB2014.14103

Motro U, Oz C, Adelman R, Davidson A, Gast A, Hermon D, et al. Allele frequencies of nine STR loci of Jewish and Arab populations in Israel. Int J Legal Med. 2002;116: 184-86. https://doi.org/10.1007/s004140100251

Wigginton JE, Cutler DJ, Abecasis GR. A note on exact tests of Hardy-Weinberg equilibrium. The Am J Human Genet. 2005;76:887-93. https://doi.org/10.1086/429864

Hameed IA, Ommer AJ, Murad AF, Mohammed GJ. Allele frequency data of 21 autosomal short tandem repeat loci in Mesan and Basra provinces in South Iraq. Egyptian J Forensic Sci. 2015;5:150-56. https://doi.org/10.1016/j.ejfs.2014.10.003

Meirmans PG, Hedrick PW. Assessing population structure: FST and related measures. Mol Ecol Resources. 2011;11(10):5-18. https://doi.org/10.1111/j.1755-0998.2010.02927.x

Akinlolu AA, Sule N, Muhammed M, Oyedepo D, Olawole M, Adejumo M, et al. Phylogenetics of the Fulani, Hausa, Igbo and Yoruba ethnic groups of Nigeria in comparisons with other ethnic groups within and outside Africa. Int J Anthropol. 2021. (Manuscript for Review).

D’Amato ME, Kasu M. Population analysis of African Y-STR profiles with UniQ TYPER™ Y-10 genotyping system. Forensic Sci Int: Genet Suppl Series. 2017;6:e84-e5. https://doi.org/10.1016/j.fsigss.2017.09.048

Ito H, Chiku S, Inoue E, Tomita M, Morisaki T, Morisaki H et al. Estimation of haplotype frequencies, linkage-disequilibrium measures, and combination of haplotype copies in each pool by use of pooled DNA data. Am J Hum Genet. 2003;72:384-98. https://doi.org/10.1086/346116

Josephine PJ, Siegert S, Willuweit S, Nagy M, Alves C, Salazar R. A global analysis of Y-chromosomal haplotype diversity for 23 STR loci. Forensic Sci Int: Genet. 2014;12: 12-23. https://doi.org/10.1016/j.fsigen.2014.04.008

تفاصيل المقال

القسم
الأوراق البحثية الأصيلة (الإبداعية)
معلومات حقوق التأليف والنشر
Creative Commons License

هذا العمل مرخص بموجب Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License.

 يجب عليك قراءة الشروط و الأحكام الخاصة بحقوق النشر ( لقراءة الشروط اضغط هنا )